Ao passarem por um túnel o carro fica sem combustível, o casal discute e Rex deixa Saskia sozinha. Na volta, ele a encontra do lado de fora do túnel, eles discutem, mas logo fazem as pazes e Rex estaciona o veículo em um posto de gasolina.

Saskia vai comprar refrigerantes enquanto seu namorado abastece o carro. Ela desaparece misteriosamente. A última imagem da moça fica registrada em uma fotografia tirada com uma câmera polaroid, Rex observa na foto que sua namorada conversava com um sujeito esquisito, porém, a distância da imagem dificulte uma identificação detalhada.

A partir desse momento, Rex dedica todo o seu tempo para encontrar sua amada. Os anos passam, a polícia encerra o caso, mas o jovem não desiste de encontrar Saskia. O rapaz passa então a receber cartas misteriosas de uma pessoa afirmando que sabe o paradeiro de Saskia. Passados três anos do sumiço de Saskia, Rex é abordado por Raymond Lemorne (Bernard-Pierre Donnadieu).

O Silêncio do Lago é um filme que proporciona uma experiência inesquecível. À primeira vista, o enredo soa simplista, trata-se do desaparecimento de uma mulher e a crescente obsessão do seu namorado em encontra-la. Mas não espere um filme esperançoso, O Silêncio do Lago é tenso e deprimente. O desespero do protagonista é contagiante, sofremos com ele e passamos o filme todo coletando pistas para descobrir o paradeiro de Saskia.